Slate descubrió que la función de mapeo automático recién agregada era algo que los jugadores realmente necesitaban y dijo que era la única función en Super Metroid que debería haber tenido el Metroid original. El tercer crítico, James Leach, estuvo de acuerdo con Nicholson y Mott en que Super Metroid era lo que debería haber sido Mega Man X. Al concluir su reseña, Leach escribió que Super Metroid contenía todo lo que buscaba en un videojuego: «jugabilidad, trucos ocultos, armas poderosas y malvados increíblemente malvados».